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Biologie cellulaire, régénération
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Mots-clés : Culture in vitro - protoplastes -transfert de gènes - expression transitoire - Agrobacterium

Ecole(s) doctorale(s) de rattachement :

Contacts :

Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRA-AgroParisTech
Bâtiment 2
INRA Centre de Versailles-Grignon
Route de St-Cyr (RD10)
78026 Versailles Cedex France

tél : +33 (0)1 30 83 30 00 - fax : +33 (0)1 30 83 33 19


Responsable
Catherine Pannetier
Chercheur CIRAD

Yves Chupeau
Directeur de Recherche

Camille Soulhat
Technicien

 

Anciens membres
de l'équipe

 

Marie-Christine Chupeau
Ingénieur d'étude
Utilisation et culture de protoplastes

Oumaya Bouchabké-Coussa
Ingénieur de Recherches
Transformation génétique de Brachypodium distachyon

Katleen Patron
Licence 3 pro
du 16/01/12 au 16/07/12

Résumé :

L'équipe s’intéresse au contrôle des processus de régénération par organogénèse ou embryogenèse somatique ainsi qu’aux méthodes de transfert de gènes aux cellules végétales cultivées in vitro. Les objectifs concernent, soit des utilisations fondamentales (activité transitoire, knock-out, ...), soit des études plus ciblées (résistance aux stress abiotiques, utilisation de la biomasse...).

Les travaux portent sur deux plantes modèles : Arabidopsis thaliana et Brachypodium distachyon ainsi que, dans le cadre d’une collaboration avec le CIRAD sur le cotonnier (Gossypium hirsutum) et plus récemment le palmier à huile (Elaeis guineensis, Elaeis oleifera).



Résultats marquants :


Culture et utilisation des protoplastes d’Arabidopsis (M.C Chupeau, Y. Chupeau):


Les travaux conduits sur les protoplastes, prolongent et valident sur la plante modèle Arabidopsis thaliana, nos approches développées sur différentes espèces (laitue, peuplier, lin…). Pour cette espèce, dont la transformation génétique in planta est couramment pratiquée, les protoplastes offrent l’avantage de pouvoir manipuler de grandes populations de cellules dans des conditions homogènes afin de sélectionner des événements rares. Nous avons amélioré les conditions pour la culture liquide et « en masse » des protoplastes (écotype Columbia and WS), ainsi que la régénération de plantes.


Régénération de bourgeons à partir de colonies dérivées de protoplastes d'Arabidopsis thaliana (écotype WS)

 


Transfert de gènes chez Brachypodium distachyon (O. Bouchabke-Coussa, C. Soulhat)

Nous utilisons Brachypodium distachyon comme outil d’analyse fonctionnelle de gènes candidats issus de différents programmes de génomique. Les approches utilisées en routine sont la surexpression, l’extinction de gènes (miR ou RNAi) ainsi que la localisation de l’expression. Pour cela nous avons développé une méthode efficace de transfert de gènes via Agrobacterium tumefaciens et la régénération de plantes transgéniques par embryogenèse somatique, ainsi qu’une série de vecteurs basés sur la technologie Gateway permettant de cloner facilement un grand nombre de gènes candidats (pour en savoir plus). Nos activités portent principalement sur l’analyse de gènes impliqués dans la biosynthèse des parois végétales en lien direct avec les équipes « Paroi primaire » et « Paroi secondaire » de l’IJPB, mais s’étendent également à d’autres domaines d’étude comme la résistance aux maladies ou l’utilisation de l’azote via des collaborations internes ou externes.

 

 

 

 

 

 

 

 

Régénérations de plantules transformées sur cals embryogènes issu d’embryons immatures

 

Embryogenèse somatique et transfert de gènes chez le cotonnier (C. Pannetier, M. Obellianne)

L’obtention de plantes de cotonnier transgéniques est réalisée via Agrobacterium tumefaciens et régénération par embryogenèse somatique. Des améliorations ont été apportées à la méthode de transformation du cotonnier par une sélection du matériel végétal et des modifications des conditions de culture (pour en savoir plus).

Des gènes d’intérêt ont été transférés chez le cotonnier et les vecteurs de transformation permettant des études de génomique fonctionnelle du développement de la fibre de coton ont été développés.

Concernant la compréhension et la maîtrise de la régénération, l’effet de la surexpression de gènes d’Arabidopsis thaliana impliqués dans le développement du méristèmes est étudié.

Par ailleurs une étude du transcriptome des gènes associés à la mise en place de l’embryogenèse somatique est en cours (projet REGENEOME ANR-Genoplante), en utilisant la microdissection laser. Ce type d’étude est également conduit sur l’organogenèse à partir de cals de protoplastes d’Arabidopsis thaliana.

Dans le cadre de l’étude des impacts de culture des cotonniers transgéniques, nous avons plus spécifiquement étudié les possibilités de croisement entre cotonniers cultivés (tétraploïdes) et cotonniers sauvages (diploïdes). Un phénomène nouveau de production de gamètes non réduit a été mis en évidence. (pour en savoir plus)



Régénération de cotonniers transgéniques par embryogenèse somatique et transformation via Agrobacterium tumefaciens


Publications représentatives :


Articles :
Vaucheret H, et Chupeau Y. (2011) Ingested plant miRNAs regulate gene expression in animal. Cell Research advance online publication 1 November 2011; doi:10.1038/cr.2011.Cell Research, (2011) :1-3.

Konan E.K, Durand-Gasselin T, Kouadio J.Y, Flori A, Rival A, Duval Y, Pannetier C. (2010). In vitro conservation of oil palm somatic embryos for 20 years on a hormone-free culture medium: characteristics of the embryogenic cultures, derived plantlets and adult palms. Plant cell reports, 29 (1) : 1-13. http://dx.doi.org/10.1007/s00299-009-0787-y

Tessadori F, Chupeau MC , Chupeau Y, Knip M, Germann S, van DrielL, R, Franz P, Gaudin V. (2007). Large-scale dissociation and sequential reassembly of pericentric heterochromatin in dedifferentiated Arabidopsis cells. J. Cell Sciences, 120, 1200-1208.

Mazier, M., Botton, E., Flamain, F., Bouchet, JP., CourtialL, B., Chupeau, MC. , Chupeau, Y., Maisonneuve, B., Lucas, H. (2007). Successful gene tagging in lettuce using the Tnt1 retrotransposon from tobacco. Plant Physiol, 144, 18-31.


Nicolas Le Moigne, Emilie Montes, Catherine Pannetier, Herman Höfte, Patrick Navard (2008) Gradient in Dissolution Capacity of Successively Deposited Cell Wall Layers in Cotton Fibres Macromolecular symposia, 262,1, 65-71.

Commun K, Mauro MC, Chupeau Y, Boulay M, Burrus M, Jeandet P (2003) Phytoalexin production in grapevine protoplasts during isolation and culture. Plant Physiol Bioch, 41: 317-323

Djenanne S, Chauvin JE, Quilleré I, Meyer C, Chupeau Y (2002). Introduction and expression of a deregulated tobacco nitrate reductase gene in potato lead to highly reduced nitrate levels in transgenic tubers. 11, 175-184. (PubMed)

Revues et vulgarisation :
Chupeau, Y., et Davey, M. (2007). Gene transfer to plants. pp 123–142. in « Functionnal Plant Genomics ». Morot-Gaudry, JF., Lea, P. Briat, JF., Eds Science Publishers Enfield, NH, USA.

Testard, J., et Chupeau, Y. (2007) OGM : quels risques. Editions Promethée- Bordeaux

Pannetier C (2006) Les cotonniers transgéniques résistant aux insectes ravageurs. Le Sélectionneur Français, 57,29-38.

Chupeau Y (2003) Transgenic plants towards healthier food. OGM et Sante, 7-18

Communications ou posters :
Bouchabké-Coussa O, Soulhat C, Bouvier d’Yvoire M, Antelme S, Le Bris P, Sibout R. (2011) Tools and methods for functional gene analysis in Brachypodium distachyon. Examples of genes involved in cell wall synthesis, 1st European Brachypodium Workshop proceedings, p.116.

Bouchabké-Coussa O, Bouvier d’Yvoire M, Sibout R, Darracq O, Antelme S, Jouanin L, Pollet B, Dalmais M, Chupeau M-C, Pannetier C, Chupeau Y. (2010) Brachypodium distachyon as a model system for studying genes involved in cell wall synthesis, 12th World Congress of the International Association for Plant Biotechnology and 2010 Meeting of the Society of In Vitro Biology, p.164.

Pannetier C, Montes E, Bouchabke O, Hamadeh B, Obellianne M, Maia-Grondard A, Kerhoas L. (2008) Embryogenèse somatique et transfert de gènes chez le cotonnier, Gossypium hirsutum L. poster. Abstract in: Actes du colloque BIOTECH 2008 : Biotechnologies végétales et gestion durables desrésistances aux stress biotiques et abiotiques, p 202. Rennes juillet 2008.

Pannetier C, Hofs JL, Montes E, Eber F, Coriton O, Huteau V, Hau B, Chevre AM (2009) Evidence of unreduced gamete production from interspecific crosses between Gossypium hirsutum and G. herbaceum. In International Conference on Polyploidy, Hybridization and Biodiversity May 17-20 St Malo France p 91.

Publications pour la jeunesse :
Le Quérré V, Chupeau Y, Legrand P, LeGuyader H (1999). La reine rouge (BD garantie avec OGM). INRA Editions.

 

 
 


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