Le Centre de Ressources pour la génomique met à disposition de toute la communauté scientifique les trois collections suivantes:

• Une collection de 55 000 mutants d'insertion indépendants obtenus par mutagenèse T-DNA.
  Cette collection de mutants a été construite par insertion d’une cassette d’ADN dans l’écotype WS. La méthode de transformation utilise les propriétés de transfert de la bactérie du sol, Agrobacterium tumefaciens. Un total de 55 000 transformants a été obtenu avec une répartition en première approximation aléatoire des insertions sur le génome. On estime ainsi avoir potentiellement produit des mutants pour 80% des gènes chez A. thaliana.
  Chaque mutant “knock-out” peut être observé ; le phénotype donnant des indications sur la fonction du gène inactivé. Il est aussi possible de rechercher un mutant dans un gène de séquence connue mais de fonction inconnue et d’observer son comportement.
  Chaque transformant est maintenu sous la forme d’une lignée d’autofécondation nommée Tn (n désignant la génération d’autofécondation). Fin 2005 tous les mutants seront disponibles en T3.
  La base de données Agrobact+ compile des informations sur les phénotypes des lignées (ségrégations de divers phénotypes observés in vitro ou en serre…). La base de données Flagdb++ donne diverses informations moléculaires dont les localisations des gènes et les sites d’insertion de la cassette d’ADN introduite.
• Une collection de plus de 500 écotypes.
  Plus de 500 populations d’origines géographiques différentes ont été rassemblées. Cette collection permet d’évaluer la diversité naturelle de l’espèce et de repérer des populations aux comportements particuliers qui seront étudiées de manière plus approfondie.
  Á partir de chacune des populations, une plante à été isolée. Cette plante auto-fécondée constitue une lignée ou accession de référence pour l’écotype. Chaque accession est génotypée et sa carte d’identité moléculaire, en cours de constitution, sera utilisée dans le cadre d’un contrôle qualité.
  Une “core collection” qui maximise la diversité génétique avec un nombre réduit d’accessions a été mise en place (voir “Génotypage à haut débit”). Elle permet la mise en oeuvre d’expérimentations qui ne pourraient pas être conduites avec la population mondiale.
  Des informations générales ou “informations passeports” sont disponibles au sein de la base de données VNat. Des informations moléculaires ou de génotypage sont disponibles sur demande et bientôt sur la base de données.
• Une trentaine de populations d'environ 500 lignées recombinantes (RIL) chacune.
  Les populations construites vont permettre d’étudier le déterminisme génétique de caractères complexes. En effet, si chaque mutant apporte des informations sur la fonction d’un gène, de nombreux caractères sont le résultat de l’expression d’un ensemble de gènes, dans l’espace (différents organes) et dans le temps (différents stades de développement). L’observation de la ségrégation de ces caractères complexes au sein de chaque population de RIL permettra de repérer l’ensemble des allèles, issus de chacun des parents du croisement, qui vont contribuer à l’expression du caractère étudié.
  Une trentaine d’accessions ont été croisées avec l’écotype de référence Columbia. Issues de chaque croisement, environ 500 lignées F2 sont propagées en descendance mono-graine jusqu’en génération F6 . Chacune de ces populations de lignées recombinantes sera cartographiée à l’aide marqueurs SNP (voir “Génotypage à haut débit”) de manière à identifier et localiser la contribution de chaque génome parental. Les populations qui sont menées en F7 en priorité, sont celles qui sont issues des croisements entre les accessions du noyau le plus réduit de la core collection et l’accession Col-0.
  Les informations concernant la cartographie et la disponibilité des populations de RIL sont disponibles au sein de la base de données VNat.

Les différentes ressources biologiques, issues des trois collections, peuvent être commandées ici.
Les frais de manipulation et d’envoi sont les suivants :