Du Gène à la Fonction (GF)

Suivi de la division cellulaire chez Arabidopsis avec le marqueur de microtubules MTB-GFP (cliquez sur l'image pour voir la video)

Nom : Du Gène à la fonction, Année M2 Semestre S1
Responsable : Jean-Denis Faure et Christian Meyer
Type de module : cours
Mention : Sciences du Végétal

Objectifs : La disponibilité de données de génétique et de génomique ainsi que la diversité des approches ont donné un nouvel essor à la biologie du développement des plantes. Ce module spécialisé présentera au travers de cours et de TD quelques approches de génétique fonctionnelle disponibles actuellement pour aborder l'étude de processus complexes. L'enseignement mettra en particulier l'accent sur l'ensemble des ressources de génomique fonctionnelle disponibles actuellement autour du système modèle Arabidopsis thaliana. Les thématiques abordées illustreront l'utilisation d'Arabidopsis comme moyen de transfert de connaissance et d'outils vers d'autres espèces, en particulier les espèces d'intérêt agronomique.

Plan des enseignements :

Programme et cours 2011

Détail des cours GF (autres années): 2004, 2010

 

1- Outils de génomique fonctionnelle chez Arabidopsis

Ressources biologiques et analyse génétique chez Arabidopis.
Analyse Génétique: mutants et ségrégations (TD), cartographie et clonage positionnel (TD), QTLs; génétique nucléo-mitochondriale.
Analyse des bases de données de génétique fonctionnelles (structure et annotation des gènes, mutants, polymorphismes, transcriptome, interaction protéine-protéine). Etude d'accession d'Arabidopsis en travail individuel (TD).

2- Génomique fonctionnelle du métabolisme: à la recherche de nouveaux gènes

• Approche génétique et chimie : A la recherche d’une nouvelle hormone végétale
  Analyse fonctionnelle du pouvoir pathogène des champignons
  Génétique fonctionnelle et cellulaire : exemple du cytosquelette
  
  

Sites web utilisés pendant le TD bioinformatique, caractériser une accession d'Arabidopsis.

Contrôle des connaissances
Question écrite de synthèse au cours de la semaine d'évaluation en novembre.
___________________________________________________________________________

Pour plus de renseignement

Jean-Denis Faure
Laboratoire de Différenciation et polarité cellulaire
INRA
Route de St. Cyr, 78026 Versailles cedex

___________________________________________________________________________