Analyse de la fonction des RNaseIII d’Arabidopsis

Les microRNA (miRNA), les short interfering RNA (siRNA) et les piwi-interacting RNA (piRNA) constituent trois catégories de petits RNA de 20 à 30-nucléotides impliqués dans la stabilité des génomes et le contrôle du développement chez les eucaryotes. Ces petits RNA régulent l’expression de gènes endogènes, contrôlent le mouvement des éléments transposables, participent à la structuration de l’hétérochromatine, et protègent les cellules contre des agents pathogènes (virus, bactéries). Chez les plantes, on ne trouve pas de piRNA mais on trouve des miRNAs et plusieurs catégories de siRNA produits par quatre RNase III de type Dicer (appellées DCL pour Dicer-like). Ces quatre DCL produisent des petits RNA de tailles différentes et présente chacune un niveau de spécialisation mais aussi des redondances fonctionnelles partielles. En plus des DCL, les plantes possèdent plusieurs gènes codant des RNaseIII de fonctions inconnues appelées RTL (RNaseIII-like). Ce projet vise à caractériser l’activité biochimique des cinq RTL d’Arabidopsis et à déterminer leur rôle biologique chez la plante. Ce projet utilise des approches de génétique (construction de mutants et de plantes et de levures transgéniques), de biochimie (analyse du transcriptome et du protéome), et de bioinformatique (séquençage à haut débit des petits RNA de plantes ou de levure).

Sujet de thèse IJPB 2010 de l'équipe Epigénétique et petits ARNs